عرض مصدر ORF8

{{Infobox protein family
| class = <!-- to save space: mw-collapsible mw-collapsed -->
| Symbol = bCoV_NS8
| Name = بروتين NS8 لفيروس كورونا بيتا
| image = 7jtl sarscov2 orf8 dimer.png
| caption = [[مثنوي بروتين]] ORF8 الخاص ب[[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2|سارس-كوف-2]]. روابط [[ثنائي كبريتيد|ثنائي الكبريتيد]] الداخلية ظاهرة بالأصفر، وبين الجزيئية بالوردي. من {{PDB|7JTL}}.<ref name=flower_2021 />
| Pfam = PF12093
| Pfam_clan =
| InterPro = IPR022722
| SMART =
| PROSITE =
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP =
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CAZy =
| CDD =
| Membranome superfamily =
| Membranome family =
}}
'''ORF8''' هو [[جين]] يُشفر [[بروتين فيروسي#بروتينات منظمة وملحقة فيروسية|البروتين الفيروسي الملحق]] بروتين NS8 لفيروس كورونا بيتا، ويتواجد في [[جنيس (تصنيف)|جنيس]] [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة|فيروسات كورونا البائية السارسية]] (Sarbecovirus). وهو أحد أقل الجينات [[تسلسل محفوظ|انحفاظا]] وأكثرها تغيرا في الجينوم.<ref name="tan_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Tan |مؤلف1-الأول=Yongjun |مؤلف2-الأخير=Schneider |مؤلف2-الأول=Theresa |مؤلف3-الأخير=Leong |مؤلف3-الأول=Matthew |مؤلف4-الأخير=Aravind |مؤلف4-الأول=L. |مؤلف5-الأخير=Zhang |مؤلف5-الأول=Dapeng |عنوان=Novel Immunoglobulin Domain Proteins Provide Insights into Evolution and Pathogenesis of SARS-CoV-2-Related Viruses |صحيفة=mBio |تاريخ=30 June 2020 |المجلد=11 |العدد=3 |doi=10.1128/mBio.00760-20|pmid=32471829 |pmc=7267882 }}</ref><ref name="zinzula_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Zinzula |مؤلف1-الأول=Luca |عنوان=Lost in deletion: The enigmatic ORF8 protein of SARS-CoV-2 |صحيفة=Biochemical and Biophysical Research Communications |تاريخ=January 2021 |المجلد=538 |صفحات=116–124 |doi=10.1016/j.bbrc.2020.10.045|pmid=33685621 |pmc=7577707 }}</ref><ref name="redondo_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Redondo |مؤلف1-الأول=Natalia |مؤلف2-الأخير=Zaldívar-López |مؤلف2-الأول=Sara |مؤلف3-الأخير=Garrido |مؤلف3-الأول=Juan J. |مؤلف4-الأخير=Montoya |مؤلف4-الأول=Maria |عنوان=SARS-CoV-2 Accessory Proteins in Viral Pathogenesis: Knowns and Unknowns |صحيفة=Frontiers in Immunology |تاريخ=7 July 2021 |المجلد=12 |صفحات=708264 |doi=10.3389/fimmu.2021.708264|pmid=34305949 |pmc=8293742 |hdl=10261/249329 |hdl-access=free |doi-access=free }}</ref><ref name="forni_2017">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Forni |مؤلف1-الأول=Diego |مؤلف2-الأخير=Cagliani |مؤلف2-الأول=Rachele |مؤلف3-الأخير=Clerici |مؤلف3-الأول=Mario |مؤلف4-الأخير=Sironi |مؤلف4-الأول=Manuela |عنوان=Molecular Evolution of Human Coronavirus Genomes |صحيفة=Trends in Microbiology |تاريخ=January 2017 |المجلد=25 |العدد=1 |صفحات=35–48 |doi=10.1016/j.tim.2016.09.001|pmid=27743750 |pmc=7111218 }}</ref> في بعض الفيروسات، قسمت [[حذف (وراثة)|طفرة حذف]] منطقة الجين إلى [[قالب قراءة مفتوح|إطاري قراءة مفتوح]] صغيرين سُميا: ORF8a وORF8b وهي ميزة في العديد من عينات [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 1|سارس-كوف]] المعزولة لاحقا من [[تفشي السارس 2002-2004|تفشي السارس]]، وكذلك من بعض فيروسات كورونا الخفاشية.<ref name=zinzula_2021 /><ref name=redondo_2021 /> لهذا السبب يُسمى الطول الكامل للجين في بعض الأحيان ORF8ab.{{فاصل}}<ref name=zinzula_2021 /><ref name="liu_2014">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Liu |مؤلف1-الأول=DX |مؤلف2-الأخير=Fung |مؤلف2-الأول=TS |مؤلف3-الأخير=Chong |مؤلف3-الأول=KK |مؤلف4-الأخير=Shukla |مؤلف4-الأول=A |مؤلف5-الأخير=Hilgenfeld |مؤلف5-الأول=R |عنوان=Accessory proteins of SARS-CoV and other coronaviruses. |صحيفة=Antiviral Research |تاريخ=September 2014 |المجلد=109 |صفحات=97–109 |doi=10.1016/j.antiviral.2014.06.013 |pmid=24995382|pmc=7113789 }}</ref> يشفر الجين كامل الطول في [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2|سارس-كوف-2]] بروتينا يحتوي على {{وإو|نطاق غلوبولين مناعي|Immunoglobulin domain}} غير معروف الوظيفة، ربما له دور في التآثرات مع جهاز مناعة [[عائل (أحياء)|المضيف]].<ref name="flower_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Flower |مؤلف1-الأول=Thomas G. |مؤلف2-الأخير=Buffalo |مؤلف2-الأول=Cosmo Z. |مؤلف3-الأخير=Hooy |مؤلف3-الأول=Richard M. |مؤلف4-الأخير=Allaire |مؤلف4-الأول=Marc |مؤلف5-الأخير=Ren |مؤلف5-الأول=Xuefeng |مؤلف6-الأخير=Hurley |مؤلف6-الأول=James H. |عنوان=Structure of SARS-CoV-2 ORF8, a rapidly evolving immune evasion protein |صحيفة=Proceedings of the National Academy of Sciences |تاريخ=12 January 2021 |المجلد=118 |العدد=2 |صفحات=e2021785118 |doi=10.1073/pnas.2021785118|pmid=33361333 |pmc=7812859 }}</ref><ref name=zinzula_2021 /><ref name=redondo_2021 /> يتشابه بروتين هذا الجين في البنية مع بروتين [[ORF7a]] ما يوحي بإمكانية نشوئه عبر [[تكرار (وراثة)|تضاعف جيني]].<ref name="mariano_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Mariano |مؤلف1-الأول=Giuseppina |مؤلف2-الأخير=Farthing |مؤلف2-الأول=Rebecca J. |مؤلف3-الأخير=Lale-Farjat |مؤلف3-الأول=Shamar L. M. |مؤلف4-الأخير=Bergeron |مؤلف4-الأول=Julien R. C. |عنوان=Structural Characterization of SARS-CoV-2: Where We Are, and Where We Need to Be |صحيفة=Frontiers in Molecular Biosciences |تاريخ=17 December 2020 |المجلد=7 |صفحات=605236 |doi=10.3389/fmolb.2020.605236|pmid=33392262 |pmc=7773825 |doi-access=free }}</ref><ref name="neches_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Neches |مؤلف1-الأول=Russell Y. |مؤلف2-الأخير=Kyrpides |مؤلف2-الأول=Nikos C. |مؤلف3-الأخير=Ouzounis |مؤلف3-الأول=Christos A. |عنوان=Atypical Divergence of SARS-CoV-2 Orf8 from Orf7a within the Coronavirus Lineage Suggests Potential Stealthy Viral Strategies in Immune Evasion |صحيفة=mBio |تاريخ=23 February 2021 |المجلد=12 |العدد=1 |doi=10.1128/mBio.03014-20|pmid=33468697 |pmc=7845636 }}</ref>
== البنية ==
يُشفر الـORF8 في سارس-كوف-2 بروتينا طوله 121 حمض أميني يحتوي على [[ببتيد إشعاري]] في [[نهاية أمينية|النهاية الأمينية]].<ref name=redondo_2021 /> ويشكل [[مثنوي بروتين|مثنويا]] مترابط [[رابطة تساهمية|تساهميا]] عبر روابط [[ثنائي كبريتيد]].<ref name=flower_2021 /> ويملك [[نطاق بروتين|نطاقا]] مشابها لنطاق الغلوبولين المناعي له تماثل بعيد مع بروتين [[ORF7a]].<ref name=flower_2021 /><ref name=tan_2020 /> رغم [[تطوي البروتين|التطوي]] المتماثل إجماليا، فإن [[غرز (وراثة)|طفرة غرز]] في الـORF8 على الأرجح مسؤولة على [[تآثرات البروتين-بروتين|تآثرات بروتين بروتين]] مختلفة وتُحدِث واجهة تثني إضافية.<ref name=flower_2021 /><ref name=tan_2020 /> على عكس الـORF7a، لا يملك الـORF8 [[نطاق عبر غشائي|لولبا عبر غشائي]] وبالتالي ليس [[بروتين عبر غشائي|بروتينا عبر غشائي]]،<ref name=flower_2021 /><ref name=redondo_2021 /> لكن اقتُرح أنه ربما يملك هيئة إرساء في الغشاء.<ref name=zinzula_2021 />
الـORF8 في سارس-كوف وسارس-كوف-2 {{وإو|لغ=en|تر=Genetic divergence|عر=تباعد جيني|نص=متباعد}} ومتباين وله [[تراصف تسلسلي|تماثل تسلسل]] أقل من 20% بينهما.<ref name=flower_2021 /> يشفر الـORF8 ذو الطول الكامل في سارس-كوف بروتينا طوله 122 حمض أميني، وهو منقسم في العديد من مستخلصات سارس-كوف إلى ORF8a وORF8b ويشفران بروتينين طولهما 39 حمض أميني و81 حمض أميني على التوالي.<ref name=liu_2014 /> اقتُرح أن بروتيني ORF8a وORF8b قد يشكلان [[مركب بروتيني|مركبا بروتينيا]].<ref name=tan_2020 /><ref name="vonbrunn_2007">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=von Brunn |مؤلف1-الأول=Albrecht |مؤلف2-الأخير=Teepe |مؤلف2-الأول=Carola |مؤلف3-الأخير=Simpson |مؤلف3-الأول=Jeremy C. |مؤلف4-الأخير=Pepperkok |مؤلف4-الأول=Rainer |مؤلف5-الأخير=Friedel |مؤلف5-الأول=Caroline C. |مؤلف6-الأخير=Zimmer |مؤلف6-الأول=Ralf |مؤلف7-الأخير=Roberts |مؤلف7-الأول=Rhonda |مؤلف8-الأخير=Baric |مؤلف8-الأول=Ralph |مؤلف9-الأخير=Haas |مؤلف9-الأول=Jürgen |عنوان=Analysis of Intraviral Protein-Protein Interactions of the SARS Coronavirus ORFeome |صحيفة=PLOS ONE |تاريخ=23 May 2007 |المجلد=2 |العدد=5 |صفحات=e459 |doi=10.1371/journal.pone.0000459|pmid=17520018 |pmc=1868897 |bibcode=2007PLoSO...2..459V |doi-access=free }}</ref> الحمض الأميني [[سيستئين]] المسؤول على تثني بروتين سارس-كوف-2 غير منحفظ في تسلسل سارس-كوف.<ref name=flower_2021 /> أُبلغ كذلك أن بروتين ORF8ab يشكل أيضا [[بنية بروتين رابعية|بروتينا متعدد القسيمات]] مرتبطا بروابط ثنائي كبريتيد.<ref name="oostra_2007">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Oostra |مؤلف1-الأول=Monique |مؤلف2-الأخير=de Haan |مؤلف2-الأول=Cornelis A. M. |مؤلف3-الأخير=Rottier |مؤلف3-الأول=Peter J. M. |عنوان=The 29-Nucleotide Deletion Present in Human but Not in Animal Severe Acute Respiratory Syndrome Coronaviruses Disrupts the Functional Expression of Open Reading Frame 8 |صحيفة=Journal of Virology |تاريخ=15 December 2007 |المجلد=81 |العدد=24 |صفحات=13876–13888 |doi=10.1128/JVI.01631-07|pmid=17928347 |pmc=2168875 }}</ref>
=== تعديلات ما بعد الترجمة ===
يُعدل بروتين ORF8ab كامل الطول الخاص بسارس-كوف [[تعديل ما بعد الترجمة|بعد الترجمة]] عبر [[غلكزة N]]،<ref name=liu_2014 /> وهو الأمر الذي يُعتقد أنه محفوظ لدى بروتين سارس-كوف-2.<ref name=flower_2021 /> تحت الظروف التجريبة، يتم ربط كل من 8b و8ab بال[[يوبيكويتين]].<ref name=liu_2014 />
== التعبير والتموقع ==
إلى جانب جينات البروتينات الملحقة الأخرى، يتواجد جين ORF8 بالقرب من الجينات التي تشفر [[بروتين فيروسي#بروتينات بنيوية فيروسية|البروتينات البنيوية]] في [[الاتجاهية (علم الأحياء الجزيئي)#النهاية 3'|النهاية 3']] لجينوم فيروسات كورونا الرنوي. إلى جانب كل من [[ORF6]] و[[ORF7a]] و[[ORF7b]]، يتموضع ORF8 بين جيني [[البروتين الغشائي لفيروس كورونا|الغشاء]] و[[بروتين القفيصة النووية لفيروس كورونا|القفيصة النووية]].<ref name=redondo_2021 /><ref name=liu_2014 /> يملك بروتين ORF8 الخاص بسارس-كوف-2 [[ببتيد إشعاري]] [[توجيه البروتين|لنقله]] إلى [[شبكة إندوبلازمية|الشبكة الإندوبلازمية]] وتم نقله في الظروف المختبرية إلى الشبكة الإندوبلازمية كذلك.<ref name="zhang_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Zhang |مؤلف1-الأول=Jing |مؤلف2-الأخير=Cruz-cosme |مؤلف2-الأول=Ruth |مؤلف3-الأخير=Zhuang |مؤلف3-الأول=Meng-Wei |مؤلف4-الأخير=Liu |مؤلف4-الأول=Dongxiao |مؤلف5-الأخير=Liu |مؤلف5-الأول=Yuan |مؤلف6-الأخير=Teng |مؤلف6-الأول=Shaolei |مؤلف7-الأخير=Wang |مؤلف7-الأول=Pei-Hui |مؤلف8-الأخير=Tang |مؤلف8-الأول=Qiyi |عنوان=A systemic and molecular study of subcellular localization of SARS-CoV-2 proteins |صحيفة=Signal Transduction and Targeted Therapy |تاريخ=December 2020 |المجلد=5 |العدد=1 |صفحات=269 |doi=10.1038/s41392-020-00372-8|pmid=33203855 |pmc=7670843 }}</ref> وعلى الأرجح هو [[بروتين إفرازي|بروتين يتم إفرازه]] خارج الخلية.<ref name=zinzula_2021 /><ref name=redondo_2021 />
توجد تقارير مختلفة في المنشورات العلمية بخصوص تموقع بروتينات 8a و8b و8ab الخاصة بسارس-كوف.<ref name=liu_2014 /> وغير واضح ما إذا كان يُعبر عن ORF8b بمستويات معتبرة تحت الظروف الطبيعية.<ref name=oostra_2007 /><ref name="mcbride_2012">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=McBride |مؤلف1-الأول=Ruth |مؤلف2-الأخير=Fielding |مؤلف2-الأول=Burtram |عنوان=The Role of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)-Coronavirus Accessory Proteins in Virus Pathogenesis |صحيفة=Viruses |تاريخ=7 November 2012 |المجلد=4 |العدد=11 |صفحات=2902–2923 |doi=10.3390/v4112902|pmid=23202509 |pmc=3509677 |doi-access=free }}</ref> يبدو أن الـORF8ab كامل الطول يتموقع في الشبكة الإندوبلازمية.<ref name=mcbride_2012 />
== الوظيفة ==
وظيفة بروتين ORF8 غير معروفة، وهو ليس [[جين لازم|أساسيا]] [[تنسخ الفيروس|لتضاعف الفيروس]] سواء في سارس-كوف<ref name=liu_2014 /> أو سارس-كوف-2،<ref name=redondo_2021 /> ومع ذلك توجد دلائل متضاربة حول ما إذا كان فقدان ORF8 يؤثر على فعالية تكاثر الفيروس.<ref name="mohammad_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Mohammad |مؤلف1-الأول=Sameer |مؤلف2-الأخير=Bouchama |مؤلف2-الأول=Abderrezak |مؤلف3-الأخير=Mohammad Alharbi |مؤلف3-الأول=Bothina |مؤلف4-الأخير=Rashid |مؤلف4-الأول=Mamoon |مؤلف5-الأخير=Saleem Khatlani |مؤلف5-الأول=Tanveer |مؤلف6-الأخير=Gaber |مؤلف6-الأول=Nusaibah S. |مؤلف7-الأخير=Malik |مؤلف7-الأول=Shuja Shafi |عنوان=SARS-CoV-2 ORF8 and SARS-CoV ORF8ab: Genomic Divergence and Functional Convergence |صحيفة=Pathogens |تاريخ=20 August 2020 |المجلد=9 |العدد=9 |صفحات=677 |doi=10.3390/pathogens9090677|pmid=32825438 |pmc=7558349 |doi-access=free }}</ref>
أحد الوظائف المفترضة لبروتين ORF8 هي التآثر مع [[جهاز مناعي|جهاز مناعة]] [[عائل (أحياء)|المضيف]].<ref name=mohammad_2020 /> يُعتقد أن لبروتين سارس-كوف-2 دور في تعديل المناعة عبر [[هروب مستضدي|التهرب المناعي]] أو تثبيط الاستجابات المناعية.<ref name=flower_2021 /><ref name=zinzula_2021 /><ref name=redondo_2021 /> أُبلغ أنه مناهض لل[[إنترفيرون نوع 1]] و[[تنظيم بالإنقاص وتنظيم بالزيادة|يخفض التعبير]] عن ال[[معقد التوافق النسيجي الكبير القسم 1|صنف 1 من معقد التوافق النسيجي الكبير]].<ref name=zinzula_2021 /><ref name=redondo_2021 /> بروتين ORF8 الخاص بسارس-كوف-2 شديد [[توليد المناعة]] ووُجدت مستويات عالية من [[جسم مضاد|الأجسام المضادة]] له لدى المرضى المتعافين من [[مرض فيروس كورونا 2019|كوفيد 19]].<ref name=redondo_2021 /><ref name="hachim_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Hachim |مؤلف1-الأول=Asmaa |مؤلف2-الأخير=Kavian |مؤلف2-الأول=Niloufar |مؤلف3-الأخير=Cohen |مؤلف3-الأول=Carolyn A. |مؤلف4-الأخير=Chin |مؤلف4-الأول=Alex W. H. |مؤلف5-الأخير=Chu |مؤلف5-الأول=Daniel K. W. |مؤلف6-الأخير=Mok |مؤلف6-الأول=Chris K. P. |مؤلف7-الأخير=Tsang |مؤلف7-الأول=Owen T. Y. |مؤلف8-الأخير=Yeung |مؤلف8-الأول=Yiu Cheong |مؤلف9-الأخير=Perera |مؤلف9-الأول=Ranawaka A. P. M. |الأخير10=Poon |الأول10=Leo L. M. |الأخير11=Peiris |الأول11=J. S. Malik |الأخير12=Valkenburg |الأول12=Sophie A. |عنوان=ORF8 and ORF3b antibodies are accurate serological markers of early and late SARS-CoV-2 infection |صحيفة=Nature Immunology |تاريخ=October 2020 |المجلد=21 |العدد=10 |صفحات=1293–1301 |doi=10.1038/s41590-020-0773-7|pmid=32807944 |s2cid=221136730 }}</ref>
اقتُرح أن بروتين ORF8a الخاص بسارس كوف يتجمع إلى عديد قسيمات ويشكل [[فيروبورين]].<ref name="chen_2011">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Chen |مؤلف1-الأول=Cheng-Chang |مؤلف2-الأخير=Krüger |مؤلف2-الأول=Jens |مؤلف3-الأخير=Sramala |مؤلف3-الأول=Issara |مؤلف4-الأخير=Hsu |مؤلف4-الأول=Hao-Jen |مؤلف5-الأخير=Henklein |مؤلف5-الأول=Peter |مؤلف6-الأخير=Chen |مؤلف6-الأول=Yi-Ming Arthur |مؤلف7-الأخير=Fischer |مؤلف7-الأول=Wolfgang B. |عنوان=ORF8a of SARS-CoV forms an ion channel: Experiments and molecular dynamics simulations |صحيفة=Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes |تاريخ=February 2011 |المجلد=1808 |العدد=2 |صفحات=572–579 |doi=10.1016/j.bbamem.2010.08.004|pmid=20708597 |pmc=7094593 }}</ref>
== التطور ==
[[ملف:7jtl orf8 7ci3 orf7a superposition.png|تصغير|يسار|[[تراصف بنيوي|رصف بنيوي]] لنطاقي الغلوبولين المناعي لـORF8 بالأزرق ({{PDB|7JTL}}<ref name=flower_2021 />) والـORF7a بالبرتقالي ({{PDB|7CI3}}<ref name="zhou_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Zhou |مؤلف1-الأول=Ziliang |مؤلف2-الأخير=Huang |مؤلف2-الأول=Chunliu |مؤلف3-الأخير=Zhou |مؤلف3-الأول=Zhechong |مؤلف4-الأخير=Huang |مؤلف4-الأول=Zhaoxia |مؤلف5-الأخير=Su |مؤلف5-الأول=Lili |مؤلف6-الأخير=Kang |مؤلف6-الأول=Sisi |مؤلف7-الأخير=Chen |مؤلف7-الأول=Xiaoxue |مؤلف8-الأخير=Chen |مؤلف8-الأول=Qiuyue |مؤلف9-الأخير=He |مؤلف9-الأول=Suhua |الأخير10=Rong |الأول10=Xia |الأخير11=Xiao |الأول11=Fei |الأخير12=Chen |الأول12=Jun |الأخير13=Chen |الأول13=Shoudeng |عنوان=Structural insight reveals SARS-CoV-2 ORF7a as an immunomodulating factor for human CD14+ monocytes |صحيفة=iScience |تاريخ=March 2021 |المجلد=24 |العدد=3 |صفحات=102187 |doi=10.1016/j.isci.2021.102187|pmid=33615195 |pmc=7879101 |bibcode=2021iSci...24j2187Z }}</ref>) يوضح مدى التماثل في طوبولوجيا {{وإو|سندويتش بيتا|Beta-sandwich}} الخاص بكل واحد منها.]]
التاريخ ال[[التطور|تطوري]] لـORF8 معقد، ويُعتبر أحد أقل المناطق انحفاظا في جينوم [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة|فيروسات كورونا البائية السارسية]].<ref name=tan_2020 /><ref name=zinzula_2021 /><ref name=redondo_2021 /> وهو عرضة لطفرات و[[حذف (وراثة)|حذوفات]] ووصف بأنه «مفرط التغير» وأنه {{وإو|منطقة تأشيب ساخنة|Recombination hotspot}}.<ref name=zinzula_2021 /> اقتُرح وجود [[بنية حمض نووي ثانوية|بُنى رنا ثانوية]] في تلك المنطقة لها علاقة ب[[عدم استقرار الجينوم]].<ref name=zinzula_2021 /><ref name="pereira_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Pereira |مؤلف1-الأول=Filipe |عنوان=Evolutionary dynamics of the SARS-CoV-2 ORF8 accessory gene |صحيفة=Infection, Genetics and Evolution |تاريخ=November 2020 |المجلد=85 |صفحات=104525 |doi=10.1016/j.meegid.2020.104525|pmid=32890763 |pmc=7467077 }}</ref>
في سارس-كوف، يُعتقد بأن منطقة الـORF8 نشأت عبر [[إعادة التركيب الجيني|تأشيب]] بين أسلاف فيروسات كورونا [[خفاشيات|الخفاشية]].<ref name=zinzula_2021 /><ref name="forni_2017" /><ref name=liu_2014 /><ref name="lau_2015">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Lau |مؤلف1-الأول=Susanna K. P. |مؤلف2-الأخير=Feng |مؤلف2-الأول=Yun |مؤلف3-الأخير=Chen |مؤلف3-الأول=Honglin |مؤلف4-الأخير=Luk |مؤلف4-الأول=Hayes K. H. |مؤلف5-الأخير=Yang |مؤلف5-الأول=Wei-Hong |مؤلف6-الأخير=Li |مؤلف6-الأول=Kenneth S. M. |مؤلف7-الأخير=Zhang |مؤلف7-الأول=Yu-Zhen |مؤلف8-الأخير=Huang |مؤلف8-الأول=Yi |مؤلف9-الأخير=Song |مؤلف9-الأول=Zhi-Zhong |الأخير10=Chow |الأول10=Wang-Ngai |الأخير11=Fan |الأول11=Rachel Y. Y. |الأخير12=Ahmed |الأول12=Syed Shakeel |الأخير13=Yeung |الأول13=Hazel C. |الأخير14=Lam |الأول14=Carol S. F. |الأخير15=Cai |الأول15=Jian-Piao |الأخير16=Wong |الأول16=Samson S. Y. |الأخير17=Chan |الأول17=Jasper F. W. |الأخير18=Yuen |الأول18=Kwok-Yung |الأخير19=Zhang |الأول19=Hai-Lin |last20=Woo |first20=Patrick C. Y. |عنوان=Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination |صحيفة=Journal of Virology |تاريخ=15 October 2015 |المجلد=89 |العدد=20 |صفحات=10532–10547 |doi=10.1128/JVI.01048-15|pmid=26269185 |pmc=4580176 }}</ref> من بين الميزات الأكثر تجليا في هذه المنطقة في سارس-كوف هي ظهور حذف لـ29 [[نوكليوتيد]] تسبب في انقسام [[قالب قراءة مفتوح|إطار القراءة المفتوح]] كامل الطول إلى إطارين صغيرين هما: ORF8a وORF8b. المستخلصات الفيروسية (العينات المعزولة) من بداية [[تفشي السارس 2002-2004|وباء السارس]] تملك الطول الكامل للإطار ORF8، لكن ظهرت البنية المنقسمة له في فترة لاحقة من الوباء.<ref name=zinzula_2021 /><ref name=liu_2014 /> ولوحظت بُنى مماثلة منذ ذلك الوقت في فيروسات كورونا خفاشية أخرى.<ref name="hu_2017">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Hu |مؤلف1-الأول=Ben |مؤلف2-الأخير=Zeng |مؤلف2-الأول=Lei-Ping |مؤلف3-الأخير=Yang |مؤلف3-الأول=Xing-Lou |مؤلف4-الأخير=Ge |مؤلف4-الأول=Xing-Yi |مؤلف5-الأخير=Zhang |مؤلف5-الأول=Wei |مؤلف6-الأخير=Li |مؤلف6-الأول=Bei |مؤلف7-الأخير=Xie |مؤلف7-الأول=Jia-Zheng |مؤلف8-الأخير=Shen |مؤلف8-الأول=Xu-Rui |مؤلف9-الأخير=Zhang |مؤلف9-الأول=Yun-Zhi |الأخير10=Wang |الأول10=Ning |الأخير11=Luo |الأول11=Dong-Sheng |الأخير12=Zheng |الأول12=Xiao-Shuang |الأخير13=Wang |الأول13=Mei-Niang |الأخير14=Daszak |الأول14=Peter |الأخير15=Wang |الأول15=Lin-Fa |الأخير16=Cui |الأول16=Jie |الأخير17=Shi |الأول17=Zheng-Li |عنوان=Discovery of a rich gene pool of bat SARS-related coronaviruses provides new insights into the origin of SARS coronavirus |صحيفة=PLOS Pathogens |تاريخ=30 November 2017 |المجلد=13 |العدد=11 |صفحات=e1006698 |doi=10.1371/journal.ppat.1006698|pmid=29190287 |pmc=5708621 }}</ref> لوحظت طفرات وحذوفات أيضا في [[متحورات فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2|متحورات سارس-كوف-2]].<ref name=tan_2020 /><ref name=pereira_2020 /> استنادا على ملاحظات في سارس-كوف، اقتُرح أن التغيرات في الـORF8 يمكن أن تكون لها علاقة [[تكيف المضيف|بالتكيف مع المضيف]]، لكن من الممكن أن ORF8 لا يؤثر على [[صلاحية (أحياء)|الصلاحية]] في المضيفين البشر.<ref name=forni_2017 /><ref name=pereira_2020 /> في سارس-كوف، لوحظ {{وإو|معدل Ka/Ks|Ka/Ks ratio}} عالٍ في الـORF8 يتوافق مع [[اصطفاء اتجاهي|اصطفاء إيجابي]] أو مع [[ضغط تطوري|اصطفاء خالٍ من الضغط]].<ref name=forni_2017 />
يُشفر الـORF8 بروتينا له {{وإو|نطاق غلوبولين مناعي|Immunoglobulin domain}} ذو صلة بعيد بنطاق [[ORF7a]].<ref name=flower_2021 /> اقتُرح أن الـORF8 على الأرجح تطور من الـORF7a عبر [[تكرار (وراثة)|تضاعف جيني]]،<ref name=tan_2020 /><ref name=mariano_2020 /><ref name=neches_2021 /> إلا أن بعض دراسات [[معلوماتية حيوية|المعلوماتية الحيوية]] تقترح أن كمية التشابه قد تكون منخفضة لدرجة لا تدعم حدوث تضاعف جيني والذي هو أمر غير شائع نسبيا لدى الفيروسات.<ref name=pereira_2020 /> نطاقات الغلوبولينات المناعية غير شائعة بين الفيروسات وباستثناء مجموعة فرعية في [[فيروس كورونا بيتا|فيروسات كورونا بيتا]] تملك ORF8 وORF7a، تم تحديد عدد صغير من [[فيروس كورونا ألفا|فيروسات كورونا ألفا]] الخفاشية التي تملك نطاقات مماثلة لنطاق الغلوبولين المناعي، بينما هذا النطاق غائب في [[فيروس كورونا غاما|فيروسات غاما]] و[[فيروس كورونا دلتا|فيروسات دلتا]].<ref name=tan_2020 /><ref name=neches_2021 /> الـORF8 غائب في [[فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية|ميرس-كوف]].<ref name=neches_2021 /> يمكن أن يكون اكتساب نطاقات الغلوبولين المناعي في فيروسات بيتا وغاما حدث بشكل مستقل، بينما ORF8 وORF7a يمكن أن يكون مصدرها من بروتين خاص بال[[عائل (أحياء)|مضيف]].<ref name=tan_2020 /> من الممكن كذلك أن غياب الـORF8 يعكس [[علم الوراثة التطوري البشري#فقدان الجينات|فقدانا للجين]] في تلك [[نسب (تطور)|الخطوط التطورية]].<ref name=neches_2021 />
{{-}}
== مراجع ==
{{مراجع|محاذاة=نعم}}
{{جينومات فيروس كورونا}}
{{شريط بوابات|علم الوراثة|كيمياء حيوية|علم الفيروسات}}
[[تصنيف:بروتينات فيروس كورونا]]
[[تصنيف:بروتينات فيروسية لابنيوية]]