عرض مصدر ORF7b

{{Infobox protein family
| Symbol = bCoV_NS7B
| Name = بروتين NS7b لفيروس كورونا
| image =
| width =
| caption =
| Pfam = PF11395
| Pfam_clan =
| InterPro = IPR021532
| SMART =
| PROSITE =
| MEROPS =
| SCOP =
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CAZy =
| CDD =
}}
'''ORF7b''' هو [[جين]] يتواجد في [[جنس (تصنيف)|جنس]] [[فيروس كورونا بيتا]] من [[فصيلة (تصنيف)|فصيلة]] [[فيروس كورونا|فيروسات كورونا]]، و[[تعبير جيني|يُعبّر]] عن [[بروتين فيروسي#بروتينات منظمة وملحقة فيروسية|البروتين الملحق]] بروتين NS7b لفيروس كورونا بيتا.<ref name="liu_2014">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Liu |مؤلف1-الأول=DX |مؤلف2-الأخير=Fung |مؤلف2-الأول=TS |مؤلف3-الأخير=Chong |مؤلف3-الأول=KK |مؤلف4-الأخير=Shukla |مؤلف4-الأول=A |مؤلف5-الأخير=Hilgenfeld |مؤلف5-الأول=R |عنوان=Accessory proteins of SARS-CoV and other coronaviruses. |صحيفة=Antiviral Research |تاريخ=September 2014 |المجلد=109 |صفحات=97–109 |doi=10.1016/j.antiviral.2014.06.013 |pmid=24995382|pmc=7113789 }}</ref> وهو [[بروتين عبر غشائي]] قصير شديد [[كاره للماء|الكره للماء]] ووظيفته {{وإو|لغ=en|تر=Domain of unknown function|عر=نطاق غير معروف الوظيفة|نص=غير معروفة}}.<ref name=liu_2014 /><ref name="redondo_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Redondo |مؤلف1-الأول=Natalia |مؤلف2-الأخير=Zaldívar-López |مؤلف2-الأول=Sara |مؤلف3-الأخير=Garrido |مؤلف3-الأول=Juan J. |مؤلف4-الأخير=Montoya |مؤلف4-الأول=Maria |عنوان=SARS-CoV-2 Accessory Proteins in Viral Pathogenesis: Knowns and Unknowns |صحيفة=Frontiers in Immunology |تاريخ=7 July 2021 |المجلد=12 |صفحات=708264 |doi=10.3389/fimmu.2021.708264|pmid=34305949 |pmc=8293742 |hdl=10261/249329 |hdl-access=free |doi-access=free }}</ref>
== البنية ==
بروتين الـORF7b هو بروتين عبر غشائي يملك [[نطاق عبر غشائي|لولبا عبر غشائي]] مفردا [[نهاية كربوكسيلية|نهايته الكربوكسيلية]] متجهة نحو [[عصارة خلوية|العصارة الخلوية]].<ref name=liu_2014 /> طوله في [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 1|سارس-كوف]] 44 حمض أميني وفي [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2|سارس-كوف-2]] 43 حمض أميني، مع [[تراصف تسلسلي|تماثل في التسلسل]] نسبة 85% بينهما.<ref name=redondo_2021 />
== التعبير والتموقع ==
ORF7b هو [[جين متداخل]] ويتداخل مع [[ORF7a]].<ref name="pekosz_2006">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Pekosz |مؤلف1-الأول=Andrew |مؤلف2-الأخير=Schaecher |مؤلف2-الأول=Scott R. |مؤلف3-الأخير=Diamond |مؤلف3-الأول=Michael S. |مؤلف4-الأخير=Fremont |مؤلف4-الأول=Daved H. |مؤلف5-الأخير=Sims |مؤلف5-الأول=Amy C. |مؤلف6-الأخير=Baric |مؤلف6-الأول=Ralph S. |عنوان=Structure, Expression, and Intracellular Localization of the SARS-CoV Accessory Proteins 7a and 7b |صحيفة=The Nidoviruses |سلسلة=Advances in Experimental Medicine and Biology |تاريخ=2006 |المجلد=581 |صفحات=115–120 |doi=10.1007/978-0-387-33012-9_20|pmid=17037516 |pmc=7123408 |isbn=978-0-387-26202-4 }}</ref> يُعبَّر عن هذا البروتين على الأرجح من [[رنا جينومي فرعي]] عبر [[المسح الراشح|مسحٍ راشحٍ]].<ref name=liu_2014 /> يتموقع هذا البروتين في سارس-كوف في [[جهاز غولجي]] والذي يتطلب تسلسل لولب عبر غشائي.<ref name=liu_2014 /><ref name="schaecher_2008">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Schaecher |مؤلف1-الأول=Scott R. |مؤلف2-الأخير=Diamond |مؤلف2-الأول=Michael S. |مؤلف3-الأخير=Pekosz |مؤلف3-الأول=Andrew |عنوان=The Transmembrane Domain of the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus ORF7b Protein Is Necessary and Sufficient for Its Retention in the Golgi Complex |صحيفة=Journal of Virology |تاريخ=October 2008 |المجلد=82 |العدد=19 |صفحات=9477–9491 |doi=10.1128/JVI.00784-08|pmid=18632859 |pmc=2546951 }}</ref> في سارس-كوف-2، أُبلغ أن له علاقة ب[[شبكة إندوبلازمية|الشبكة الإندوبلازمية]].<ref name="zhang_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Zhang |مؤلف1-الأول=Jing |مؤلف2-الأخير=Cruz-cosme |مؤلف2-الأول=Ruth |مؤلف3-الأخير=Zhuang |مؤلف3-الأول=Meng-Wei |مؤلف4-الأخير=Liu |مؤلف4-الأول=Dongxiao |مؤلف5-الأخير=Liu |مؤلف5-الأول=Yuan |مؤلف6-الأخير=Teng |مؤلف6-الأول=Shaolei |مؤلف7-الأخير=Wang |مؤلف7-الأول=Pei-Hui |مؤلف8-الأخير=Tang |مؤلف8-الأول=Qiyi |عنوان=A systemic and molecular study of subcellular localization of SARS-CoV-2 proteins |صحيفة=Signal Transduction and Targeted Therapy |تاريخ=December 2020 |المجلد=5 |العدد=1 |صفحات=269 |doi=10.1038/s41392-020-00372-8|pmid=33203855 |pmc=7670843 }}</ref>
== الوظيفة ==
وظيفة ORF7b غير محددة جيدا، وهو ليس [[جين لازم|أساسيا]] [[تنسخ الفيروس|لتضاعف الفيروس]].<ref name=liu_2014 /><ref name=pekosz_2006 /> توجد أدلة متضاربة من دراسات على سارس-كوف حول تأثير حذفه على فعالية التضاعف.<ref name=liu_2014 /><ref name="mcbride_2012">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=McBride |مؤلف1-الأول=Ruth |مؤلف2-الأخير=Fielding |مؤلف2-الأول=Burtram |عنوان=The Role of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)-Coronavirus Accessory Proteins in Virus Pathogenesis |صحيفة=Viruses |تاريخ=7 November 2012 |المجلد=4 |العدد=11 |صفحات=2902–2923 |doi=10.3390/v4112902|pmid=23202509 |pmc=3509677 |doi-access=free }}</ref> وُجد أن هذا البروتين يُضاف إلى الفيرونات في سارس-كوف، ما يوحي بأنه [[بروتين فيروسي#بروتينات بنيوية فيروسية|بروتين فيروسي بنوي]] ثانوي.<ref name=liu_2014 /><ref name="schaecher_2007">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Schaecher |مؤلف1-الأول=Scott R. |مؤلف2-الأخير=Mackenzie |مؤلف2-الأول=Jason M. |مؤلف3-الأخير=Pekosz |مؤلف3-الأول=Andrew |عنوان=The ORF7b Protein of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus (SARS-CoV) Is Expressed in Virus-Infected Cells and Incorporated into SARS-CoV Particles |صحيفة=Journal of Virology |تاريخ=15 January 2007 |المجلد=81 |العدد=2 |صفحات=718–731 |doi=10.1128/JVI.01691-06|pmid=17079322 |pmc=1797472 }}</ref> تم اكتشاف [[متحورات فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2|متحور لسارس-كوف-2]] به [[حذف (وراثة)|طفرة حذف]] في منطقة ORF7b نتج عنها [[بروتين اندماجي|بروتين مدمج]] بين ORF7b وORF8، وتأثيره غير معروف.<ref name=redondo_2021 /><ref name="su_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Su |مؤلف1-الأول=Yvonne C. F. |مؤلف2-الأخير=Anderson |مؤلف2-الأول=Danielle E. |مؤلف3-الأخير=Young |مؤلف3-الأول=Barnaby E. |مؤلف4-الأخير=Linster |مؤلف4-الأول=Martin |مؤلف5-الأخير=Zhu |مؤلف5-الأول=Feng |مؤلف6-الأخير=Jayakumar |مؤلف6-الأول=Jayanthi |مؤلف7-الأخير=Zhuang |مؤلف7-الأول=Yan |مؤلف8-الأخير=Kalimuddin |مؤلف8-الأول=Shirin |مؤلف9-الأخير=Low |مؤلف9-الأول=Jenny G. H. |الأخير10=Tan |الأول10=Chee Wah |الأخير11=Chia |الأول11=Wan Ni |الأخير12=Mak |الأول12=Tze Minn |الأخير13=Octavia |الأول13=Sophie |الأخير14=Chavatte |الأول14=Jean-Marc |الأخير15=Lee |الأول15=Raphael T. C. |الأخير16=Pada |الأول16=Surinder |الأخير17=Tan |الأول17=Seow Yen |الأخير18=Sun |الأول18=Louisa |الأخير19=Yan |الأول19=Gabriel Z. |last20=Maurer-Stroh |first20=Sebastian |الأخير21=Mendenhall |الأول21=Ian H. |الأخير22=Leo |الأول22=Yee-Sin |الأخير23=Lye |الأول23=David Chien |الأخير24=Wang |الأول24=Lin-Fa |الأخير25=Smith |الأول25=Gavin J. D. |عنوان=Discovery and Genomic Characterization of a 382-Nucleotide Deletion in ORF7b and ORF8 during the Early Evolution of SARS-CoV-2 |صحيفة=mBio |تاريخ=25 August 2020 |المجلد=11 |العدد=4 |doi=10.1128/mBio.01610-20|pmid=32694143 |pmc=7374062 |hdl=11343/277716 |hdl-access=free }}</ref>
== مراجع ==
{{مراجع|محاذاة=نعم}}
{{جينومات فيروس كورونا}}
{{شريط بوابات|الكيمياء الحيوية|علم الفيروسات|علم الوراثة}}
{{معرفات مركب كيميائي}}
{{بذرة جين}}
[[تصنيف:بروتينات فيروس كورونا]]
[[تصنيف:بروتينات فيروسية لابنيوية]]