عرض مصدر ORF6

{{Infobox protein family
| class = <!-- to save space: mw-collapsible mw-collapsed -->
| Symbol = bCoV_NS6
| Name = البروتين NS6 لفيروس كورونا بيتا
| image =
| caption =
| Pfam = PF12133
| Pfam_clan =
| InterPro = IPR022736
| SMART =
| PROSITE =
| MEROPS =
| CATH =
| SCOP =
| TCDB =
| OPM family =
| OPM protein =
| CAZy =
| CDD =
| Membranome superfamily =
| Membranome family =
}}
'''ORF6''' هو [[جين]] يشفر بروتينا [[بروتين فيروسي#بروتينات منظمة وملحقة فيروسية|ملحقا]] في [[جنيس (تصنيف)|الجُنيس]] فيروسات كورونا [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة|البائية السارسية]] (Sarbecovirus) من [[فيروس كورونا|فيروسات كورونا]] والذي يشمل [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 1|سارس-كوف]] و[[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2|سارس-كوف-2]]. وهو غير متواجد في [[فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية|ميرس-كوف]]. يُعتقد أنه يُخفض استجابة [[جهاز مناعي|الجهاز المناعي]] عند الإصابة بالفيروس عبر مناهضة ال[[إنترفيرون]].<ref name="liu_2014">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Liu |الأول1=Ding Xiang |الأخير2=Fung |الأول2=To Sing |الأخير3=Chong |الأول3=Kelvin Kian-Long |الأخير4=Shukla |الأول4=Aditi |الأخير5=Hilgenfeld |الأول5=Rolf |عنوان=Accessory proteins of SARS-CoV and other coronaviruses |صحيفة=Antiviral Research |تاريخ=September 2014 |المجلد=109 |صفحات=97–109 |doi=10.1016/j.antiviral.2014.06.013|pmid=24995382 |pmc=7113789 }}</ref><ref name="mcbride_2012">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=McBride |الأول1=Ruth |الأخير2=Fielding |الأول2=Burtram |عنوان=The Role of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS)-Coronavirus Accessory Proteins in Virus Pathogenesis |صحيفة=Viruses |تاريخ=7 November 2012 |المجلد=4 |العدد=11 |صفحات=2902–2923 |doi=10.3390/v4112902|pmid=23202509 |pmc=3509677 |doi-access=free }}</ref><ref name="redondo_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Redondo |الأول1=Natalia |الأخير2=Zaldívar-López |الأول2=Sara |الأخير3=Garrido |الأول3=Juan J. |الأخير4=Montoya |الأول4=Maria |عنوان=SARS-CoV-2 Accessory Proteins in Viral Pathogenesis: Knowns and Unknowns |صحيفة=Frontiers in Immunology |تاريخ=7 July 2021 |المجلد=12 |صفحات=708264 |doi=10.3389/fimmu.2021.708264|pmid=34305949 |pmc=8293742 |doi-access=free }}</ref>
== البنية ==
بروتين ORF6 قصير وطوله 63 حمض أميني في [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 1|سارس-كوف]]<ref name=mcbride_2012 /> تسلسل ORF6 غير [[تسلسل محفوظ|منحفظ]] جيدا ويملك [[تراصف تسلسلي|تطابقا تسلسليا]] منخفظا نسبيا بين الفيروسين يقدر بـ 66%.<ref name="suryawanshi_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Suryawanshi |الأول1=Rahul K. |الأخير2=Koganti |الأول2=Raghuram |الأخير3=Agelidis |الأول3=Alex |الأخير4=Patil |الأول4=Chandrashekhar D. |الأخير5=Shukla |الأول5=Deepak |عنوان=Dysregulation of Cell Signaling by SARS-CoV-2 |صحيفة=Trends in Microbiology |تاريخ=March 2021 |المجلد=29 |العدد=3 |صفحات=224–237 |doi=10.1016/j.tim.2020.12.007|pmid=33451855 |pmc=7836829 }}</ref> يملك هذا البروتين [[لولب ألفا]] [[مزدوج الألفة]] [[نهاية أمينية|بالنهاية الأمينية]] يرتبط مع [[غشاء خلوي|الغشاء]]، لكنه ليس [[بروتين عبر غشائي|بروتينا عبر غشائي]]. ذيل [[نهاية كربوكسيلية|النهاية الكربوكسيلية]] المتكون من حوالي 20 حمض أميني [[قطبية كيميائية|قطبيٌ]] ويمتد إلى [[عصارة خلوية|العصارة الخلوية]] ويحتوي [[ببتيد إشعاري|تسلسلات إشارة]] من أجل نقله إلى الأحياز الخلوية التي يتموقع فيها.<ref name=liu_2014 /><ref name=mcbride_2012 />
== التعبير والتموقع ==
مثل بقية جينات البروتينات الملحقة، يتواجد جين ORF6 قرب الجينات التي تشفر [[بروتين فيروسي#بروتينات بنيوية فيروسية|البروتينات البنيوية]] في [[الاتجاهية (علم الأحياء الجزيئي)#النهاية 3'|النهاية 3']] من الجينوم الرنوي لفيروس كورونا. إلى جانب كل من [[ORF7]] و[[ORF7b]] و[[ORF8]]، يتواجد ORF6 بين جيني [[البروتين الغشائي لفيروس كورونا|الغشاء]] و[[بروتين القفيصة النووية لفيروس كورونا|القفيصة]].<ref name=liu_2014 /><ref name=mcbride_2012 /><ref name=redondo_2021 /> يتموضع في [[شبكة إندوبلازمية|الشبكة الإندوبلازمية]] و[[جهاز غولجي]]،<ref name=liu_2014 /><ref name=mcbride_2012 /><ref name=redondo_2021 /> مع دراسات في سارس-كوف-2 تشير إلى وجود علاقة له [[حويصلة (أحياء)|بحويصلات]] مثل {{وإو|لغ=en|تر=Autophagosome|عر=جسيم بلعمي ذاتي|نص=الجسيمات البلعمية الذاتية}} و[[جسيم حال|اليحلولات]].<ref name=redondo_2021 />
== الوظيفة ==
يُعتقد أن الوظيفة الأساسية لبروتين ORF6 هي التعديل المناعي و[[مناهضة (أدوية)|مناهضة]] ال[[إنترفيرون]]، وهو ليس [[جين لازم|أساسيا]] [[تنسخ الفيروس|لتضاعف الفيروس]]. ورغم ذلك يبدو أن غيابه يُنقص من فعالية التضاعف.<ref name=liu_2014 /><ref name=mcbride_2012 />
=== تآثر مع البروتينات الفيروسية ===
تقترح دراسات في [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 1|سارس-كوف]] أن بروتين ORF6 يقوم [[تآثرات البروتين-بروتين|بتآثرات بروتين بروتين]] مع بروتين فيروسي ملحق آخر هو بروتين [[ORF9b]].<ref name=liu_2014 /><ref name="calvo_2012">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Calvo |الأول1=Enrique |الأخير2=DeDiego |الأول2=Marta L. |الأخير3=García |الأول3=Pilar |الأخير4=López |الأول4=Juan A. |الأخير5=Pérez-Breña |الأول5=Pilar |الأخير6=Falcón |الأول6=Ana |عنوان=Severe acute respiratory syndrome coronavirus accessory proteins 6 and 9b interact in vivo |صحيفة=Virus Research |تاريخ=October 2012 |المجلد=169 |العدد=1 |صفحات=282–288 |doi=10.1016/j.virusres.2012.07.012|pmid=22820404 |pmc=7114373 }}</ref> في سارس-كوف-2 وليس في [[فيروس كورونا مورين|فيروس اتهاب الكبد الفأري]] {{وإو|لغ=en|تر=Recombinant virus|عر=فيروس مؤشب|نص=المؤشب }} اكتُثشِف البروتين ORF6 في [[جسيمات شبيهة بالفيروس]] وفي [[فيروس|فيرونات]] ناضجة، وهو ما يوحي بإمكانية كونه بروتينا فيروسيا بنيويا صغيرا.<ref name=liu_2014 /><ref name=mcbride_2012 />
=== تأثيرات على المناعة ===
بروتين ORF6 في كل من سارس-كوف وسارس-كوف-2 مناهض لل[[إنترفيرون]] ويُعتقد أن له دور في [[هروب مستضدي|التهرب من المناعة]]. وُصفت العديد من تآثرات البروتين بروتين مع بروتينات الخلية المضيفة التي تتوسط هذا التهرب. فقد تم الإبلاغ عن أنه يثبط {{وإو|لغ=en|تر=Nuclear localization sequence|عر=تسلسل توجيه نووي|نص=توجيه البروتينات إلى النواة}} عبر تثبيط [[عامل نسخ|عامل النسخ]] {{وإو|لغ=en|تر=STAT protein|عر=بروتين ستات|نص=ستات}} وهو ما يثبط تنشيط الإنترفيرون.<ref name=liu_2014 /><ref name=redondo_2021 /> أبلغت دراسات في سارس-كوف أن هذا التثبيط قد يتوسطه ارتباط بروتين ORF6 ببروتينات ال{{وإو|كريوفيرين|Karyopherin}}.<ref name=liu_2014 /><ref name=suryawanshi_2021 /> في سارس-كوف-2 يتآثر بروتين ORF6 مع [[RAE1]] و[[NUP98]] وهو ما يثبط تآثرات وعمل الكريوفيرينات.<ref name=redondo_2021 /><ref name="miorin_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |الأخير1=Miorin |الأول1=Lisa |الأخير2=Kehrer |الأول2=Thomas |الأخير3=Sanchez-Aparicio |الأول3=Maria Teresa |الأخير4=Zhang |الأول4=Ke |الأخير5=Cohen |الأول5=Phillip |الأخير6=Patel |الأول6=Roosheel S. |الأخير7=Cupic |الأول7=Anastasija |الأخير8=Makio |الأول8=Tadashi |الأخير9=Mei |الأول9=Menghan |الأخير10=Moreno |الأول10=Elena |الأخير11=Danziger |الأول11=Oded |الأخير12=White |الأول12=Kris M. |الأخير13=Rathnasinghe |الأول13=Raveen |الأخير14=Uccellini |الأول14=Melissa |الأخير15=Gao |الأول15=Shengyan |الأخير16=Aydillo |الأول16=Teresa |الأخير17=Mena |الأول17=Ignacio |الأخير18=Yin |الأول18=Xin |الأخير19=Martin-Sancho |الأول19=Laura |last20=Krogan |first20=Nevan J. |الأخير21=Chanda |الأول21=Sumit K. |الأخير22=Schotsaert |الأول22=Michael |الأخير23=Wozniak |الأول23=Richard W. |الأخير24=Ren |الأول24=Yi |الأخير25=Rosenberg |الأول25=Brad R. |الأخير26=Fontoura |الأول26=Beatriz M. A. |الأخير27=García-Sastre |الأول27=Adolfo |عنوان=SARS-CoV-2 Orf6 hijacks Nup98 to block STAT nuclear import and antagonize interferon signaling |صحيفة=Proceedings of the National Academy of Sciences |تاريخ=10 November 2020 |المجلد=117 |العدد=45 |صفحات=28344–28354 |doi=10.1073/pnas.2016650117|pmid=33097660 |pmc=7668094 }}</ref>
== مراجع ==
{{مراجع|محاذاة=نعم}}
{{جينومات فيروس كورونا}}
{{شريط بوابات|علم الوراثة|كيمياء حيوية|علم الفيروسات}}
[[تصنيف:بروتينات فيروس كورونا]]
[[تصنيف:بروتينات فيروسية لابنيوية]]