عرض مصدر ORF3c

{{Infobox nonhuman protein
| Name = ORF3c
| image =
| width =
| caption =
| Organism = SARS-CoV-2
| TaxID = 2697049
| Symbol = ORF3c
| AltSymbols =
| ATC_prefix =
| ATC_suffix =
| ATC_supplemental =
| CAS_number =
| CAS_supplemental =
| DrugBank =
| EntrezGene =
| HomoloGene =
| PDB =
| RefSeqmRNA =
| RefSeqProtein =
| UniProt = P0DTG1
| ECnumber =
| Chromosome =
| EntrezChromosome =
| GenLoc_start =
| GenLoc_end =
}}
'''ORF3c''' هو [[جين]] يتواجد في [[جنيس (تصنيف)|الجُنيس]] فيروسات [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة|كورونا البائية السارسية]] (Sarbecovirus) التي تشمل [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 1|سارس-كوف]] و[[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2|سارس-كوف-2]]. تم تحديده أول مرة في جينوم سارس-كوف-2 ويشفر [[بروتين فيروسي#بروتينات لابنيوية فيروسية|بروتينا لابنيويا]] طوله 41 حمض أميني غير معروف الوظيفة.<ref name="firth_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Firth |مؤلف1-الأول=Andrew E. |عنوان=A putative new SARS-CoV protein, 3c, encoded in an ORF overlapping ORF3a |صحيفة=Journal of General Virology |تاريخ=1 October 2020 |المجلد=101 |العدد=10 |صفحات=1085–1089 |doi=10.1099/jgv.0.001469}}</ref><ref name="cagliani_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Cagliani |مؤلف1-الأول=Rachele |مؤلف2-الأخير=Forni |مؤلف2-الأول=Diego |مؤلف3-الأخير=Clerici |مؤلف3-الأول=Mario |مؤلف4-الأخير=Sironi |مؤلف4-الأول=Manuela |عنوان=Coding potential and sequence conservation of SARS-CoV-2 and related animal viruses |صحيفة=Infection, Genetics and Evolution |تاريخ=September 2020 |المجلد=83 |صفحات=104353 |doi=10.1016/j.meegid.2020.104353|pmc=7199688 }}</ref><ref name="jungreis_2021_natcom">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Jungreis |مؤلف1-الأول=Irwin |مؤلف2-الأخير=Sealfon |مؤلف2-الأول=Rachel |مؤلف3-الأخير=Kellis |مؤلف3-الأول=Manolis |عنوان=SARS-CoV-2 gene content and COVID-19 mutation impact by comparing 44 Sarbecovirus genomes |صحيفة=Nature Communications |تاريخ=December 2021 |المجلد=12 |العدد=1 |صفحات=2642 |doi=10.1038/s41467-021-22905-7|hdl=1721.1/130581 |hdl-access=free }}</ref> وهو متواجد كذلك في جينوم سارس-كوف لكن لم يتم التعرف عليه حتى تم تحديد [[تنادد|نديده]] في سارس-كوف-2.<ref name="jungreis_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Jungreis |مؤلف1-الأول=Irwin |مؤلف2-الأخير=Nelson |مؤلف2-الأول=Chase W. |مؤلف3-الأخير=Ardern |مؤلف3-الأول=Zachary |مؤلف4-الأخير=Finkel |مؤلف4-الأول=Yaara |مؤلف5-الأخير=Krogan |مؤلف5-الأول=Nevan J. |مؤلف6-الأخير=Sato |مؤلف6-الأول=Kei |مؤلف7-الأخير=Ziebuhr |مؤلف7-الأول=John |مؤلف8-الأخير=Stern-Ginossar |مؤلف8-الأول=Noam |مؤلف9-الأخير=Pavesi |مؤلف9-الأول=Angelo |الأخير10=Firth |الأول10=Andrew E. |الأخير11=Gorbalenya |الأول11=Alexander E. |الأخير12=Kellis |الأول12=Manolis |عنوان=Conflicting and ambiguous names of overlapping ORFs in the SARS-CoV-2 genome: A homology-based resolution |صحيفة=Virology |تاريخ=June 2021 |المجلد=558 |صفحات=145–151 |doi=10.1016/j.virol.2021.02.013|hdl=1721.1/130363 |hdl-access=free }}</ref>
== التسمية ==
كان هنالك خلط كبير في المنشورات العلمية حول التسمية المستخدمة للإشارة إلى البروتينات الملحقة لسارس-كوف-2، خاصة تسمية عدة [[جين متداخل|جينات متداخلة]] في الـ[[ORF3a]].<ref name=jungreis_2021 /> أشير إلى البروتين المحتمل [[ناتج جيني|إنتاجه]] من جين ORF3c على الأقل مرة واحدة «بالبروتين 3b»،<ref name="pavesi_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Pavesi |مؤلف1-الأول=Angelo |عنوان=New insights into the evolutionary features of viral overlapping genes by discriminant analysis |صحيفة=Virology |تاريخ=July 2020 |المجلد=546 |صفحات=51–66 |doi=10.1016/j.virol.2020.03.007|pmc=7157939 }}</ref> لكن لا يجب خلطه مع ناتج الجين [[ORF3b]] غير المماثل له.<ref name=jungreis_2021 /> وُصف هذا الجين كذلك بأسماء مثل "ORF3h"<ref name=cagliani_2020 /> و''ORF3a.iORF1''.{{فاصل}}<ref name="finkel_2021">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Finkel |مؤلف1-الأول=Yaara |مؤلف2-الأخير=Mizrahi |مؤلف2-الأول=Orel |مؤلف3-الأخير=Nachshon |مؤلف3-الأول=Aharon |مؤلف4-الأخير=Weingarten-Gabbay |مؤلف4-الأول=Shira |مؤلف5-الأخير=Morgenstern |مؤلف5-الأول=David |مؤلف6-الأخير=Yahalom-Ronen |مؤلف6-الأول=Yfat |مؤلف7-الأخير=Tamir |مؤلف7-الأول=Hadas |مؤلف8-الأخير=Achdout |مؤلف8-الأول=Hagit |مؤلف9-الأخير=Stein |مؤلف9-الأول=Dana |الأخير10=Israeli |الأول10=Ofir |الأخير11=Beth-Din |الأول11=Adi |الأخير12=Melamed |الأول12=Sharon |الأخير13=Weiss |الأول13=Shay |الأخير14=Israely |الأول14=Tomer |الأخير15=Paran |الأول15=Nir |الأخير16=Schwartz |الأول16=Michal |الأخير17=Stern-Ginossar |الأول17=Noam |عنوان=The coding capacity of SARS-CoV-2 |صحيفة=Nature |تاريخ=7 January 2021 |المجلد=589 |العدد=7840 |صفحات=125–130 |doi=10.1038/s41586-020-2739-1}}</ref> التسمية الموصى بها لهذا الجين في سارس-كوف-2 هي ORF3c.<ref name=jungreis_2021 />
== علم الجينوم المقارن ==
ORF3c هو [[جين متداخل]] يتداخل [[قالب قراءة مفتوح|إطاره المفتوح]] مع كل من [[ORF3a]] و[[ORF3d]] في جينوم [[فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة التنفسية الحادة الشديدة النوع 2|سارس-كوف-2]]. ويشكل هذا الأمر مثالا نادرا على إمكانية وجود ثلاث إطارات قراءة مفتوحة في نفس التسلسل تشفر بروتينات وظيفية.<ref name=jungreis_2021 /><ref name=nelson_2020 />
تقترح تحاليل [[معلوماتية حيوية|المعلوماتية الحيوية]] لتسلسلات فيروسات كورونا البائية السارسية أن تسلسل وطول ORF3c [[تسلسل محفوظ|محفوظين]] جيدا، وتشير إلى أنه على الأرجح يشفر بروتينا وظيفيا.<ref name=firth_2020 /><ref name=cagliani_2020 /><ref name=jungreis_2021_natcom /> ويبدو أنه عرضة وهدف {{وإو|لغ=en|تر=Negative selection (natural selection)|عر=اصطفاء سلبي|نص=لاصفاء تنقية}}.<ref name=firth_2020 /><ref name="nelson_2020">{{استشهاد بدورية محكمة |مؤلف1-الأخير=Nelson |مؤلف1-الأول=Chase W |مؤلف2-الأخير=Ardern |مؤلف2-الأول=Zachary |مؤلف3-الأخير=Goldberg |مؤلف3-الأول=Tony L |مؤلف4-الأخير=Meng |مؤلف4-الأول=Chen |مؤلف5-الأخير=Kuo |مؤلف5-الأول=Chen-Hao |مؤلف6-الأخير=Ludwig |مؤلف6-الأول=Christina |مؤلف7-الأخير=Kolokotronis |مؤلف7-الأول=Sergios-Orestis |مؤلف8-الأخير=Wei |مؤلف8-الأول=Xinzhu |عنوان=Dynamically evolving novel overlapping gene as a factor in the SARS-CoV-2 pandemic |صحيفة=eLife |تاريخ=1 October 2020 |المجلد=9 |صفحات=e59633 |doi=10.7554/eLife.59633|pmc=7655111 }}</ref>
== الخصائص ==
أكدت تجارب [[برفلة الريبوسوم]] أن جين ORF3c يُعبر عن [[ناتج جيني]].<ref name=finkel_2021 /> يُعتقد أن هذا البروتين القصير نسبيا الذي طوله 41 حمض أميني يحتوي على [[نطاق عبر غشائي]] يملك ميزات تقترح بأنه [[فيروبورين]].<ref name=cagliani_2020 />
== مراجع ==
{{مراجع|محاذاة=نعم}}
{{جينومات فيروس كورونا}}
{{شريط بوابات|الكيمياء الحيوية|علم الفيروسات|علم الوراثة}}
{{بذرة جين}}
[[تصنيف:بروتينات فيروس كورونا]]
[[تصنيف:بروتينات فيروسية لابنيوية]]